カメラプレビューの上にOpenGLレイヤを重ねる件、結局この辺が参考になりました。
http://groups.google.co.jp/group/android-developers/browse_thread/thread/59823f265354257f
別スレッドには、SurfaceViewは二枚重ねられない（あるいは非常にリソースを食う）のでカスタムのSurfaceViewを作るべし、という意見もありましたが、重ねられないことはないみたいだし、そもそもカメラプレビューとOpenGLを融合させるのは（プレビューイメージをバッファ経由で描画しないかぎり（ARToolkit絡みでそういう例もありました））難しいように思えます。
もっとも、その方法もやってみる価値はあるかも。イメージ転送とオーバレイのどちらが早いか、ですが、やってみないと分からないですね。時間ができたらやってみますか。
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